Untuk menunjang tercapainya pembelajaran yang berkualitas SMP YPPI-3 Menggunakan Kurikulum 2013 dalam pembelajaran.
Mata pelajaran di SMP YPPI-3 terbagi menjadi 2 yaitu mata pelajaran wajib dan mata pelajaran muatan lokal.
Mata Pelajaran Wajib
- Agama dan Budi Pekerti
- Pendidikan Kewarganegaraan
- Bahasa Indonesia
- Matematika
- IPA
- IPS
- Bahasa Inggris
- Seni Budaya
- PJOK
- Prakarya
- Bahasa Jawa
Muatan Lokal
- TIK
- Bahasa Mandarin
- Character Building
- Literasi